Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpainQ9CWY9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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