Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pfdn1Q9CWM4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pfdn1Q9CWM4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn1Q9CWM4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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