Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms