Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lims1Q99JW4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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