Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms