Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tom1l1Q923U0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms