Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms