Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitrm1Q8K411 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms