Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms