Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms