Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU5

Ccny, Cyclin-Y, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnyQ8BGU5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnyQ8BGU5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnyQ8BGU5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms