Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms