Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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