Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms