Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms