Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ulk3Q3U3Q1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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