Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dcaf17Q3TUL7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms