Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Cpne9Q1RLL3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Cpne9Q1RLL3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Cpne9Q1RLL3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Cpne9Q1RLL3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cpne9Q1RLL3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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