Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Rpusd2Q149F1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Rpusd2Q149F1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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