Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VgfQ0VGU4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms