Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pou6f1Q07916 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou6f1Q07916 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms