Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Aplp2Q06335 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aplp2Q06335 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms