Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cdk18Q04899 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cdk18Q04899 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cdk18Q04899 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cdk18Q04899 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cdk18Q04899 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cdk18Q04899 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cdk18Q04899 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cdk18Q04899 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cdk18Q04899 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk18Q04899 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms