Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms