Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms