Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb1Q00420 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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