Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gfra1P97785 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms