Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nbr1P97432 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nbr1P97432 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms