Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms