Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Setd4P58467 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms