Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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