Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atxn10P28658 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atxn10P28658 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atxn10P28658 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atxn10P28658 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atxn10P28658 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atxn10P28658 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atxn10P28658 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atxn10P28658 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atxn10P28658 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atxn10P28658 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atxn10P28658 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atxn10P28658 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Atxn10P28658 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Atxn10P28658 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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