Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BgnP28653 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BgnP28653 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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