Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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