Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Edn1P22387 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms