Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18524 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18524 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18524 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18524 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18524 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18524 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18524 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18524 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18524 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18524 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18524 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18524 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18524 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P18524 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18524 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18524 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18524 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms