Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RhoP15409 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RhoP15409 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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