Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms