Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms