Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcb1bP06795 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms