Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms