Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cldn4O35054 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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