Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20828J3KMI7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms