Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XntrpcF8VQM8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms