Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zscan18E9PUD6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan18E9PUD6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms