Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf217D3YYI7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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