Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Atp8b5A3FIN4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Atp8b5A3FIN4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Atp8b5A3FIN4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Atp8b5A3FIN4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Atp8b5A3FIN4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Atp8b5A3FIN4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Atp8b5A3FIN4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Atp8b5A3FIN4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Atp8b5A3FIN4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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