Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Padi3Q9Z184 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Padi3Q9Z184 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Padi3Q9Z184 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Padi3Q9Z184 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Padi3Q9Z184 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Padi3Q9Z184 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Padi3Q9Z184 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Padi3Q9Z184 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Padi3Q9Z184 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms