Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NbnQ9R207 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NbnQ9R207 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NbnQ9R207 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NbnQ9R207 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms