Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms